分割与精修
在 MPR 中创建、精修与交换分割,保留独立掩膜和重叠区域。
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1. 画范围
在 CT 或 PET 的 MPR → 阈值分割、或 CT 的 4D → 阈值分割 中勾选 启用,左键拖出矩形,松开完成。三切面同步显示范围;4D 仅显示当前时相的范围。
2. 设阈值
选择 绝对值 / %,输入阈值或拖动滑块。范围内 ≥ 阈值 的体素着色并参与统计;先确认 CT/PET 单位。
3. 设深度
默认深度为 √(宽 × 高),以绘制切面向两侧延伸。直接调整深度会进入 手动;切回 自动 后随宽高变化。
修改或排查
回原切面拖动内部移动,拖动角点改尺寸。无结果时检查位置、阈值、单位与深度;N = 0 表示没有符合条件的有效体素。
导出 SEG
完成分割并等待统计后,选择 导出 → 导出 SEG。导出当前标签页、当前时相的所有分割。同一源网格的区域合并为多区域二值 SEG,重叠部分分别保留;大数据按内存预算分批。空分割需先调整阈值或范围。
导入与管理 SEG
左侧导入原始 DICOM,打开对应 MPR / 4D 和时相,再通过右侧导入分割。支持原网格匹配的二值、多区域和重叠 SEG。可改名、换色、显隐、精修或删除,支持撤销与工作区保存。
画笔与橡皮
没有分割时,选择 画笔 直接绘制,第一笔完成后自动创建。已有分割时,画笔和橡皮编辑当前选中项;切换工具不会新建。点击 分割管理 旁的 + 可创建并选中空分割,新区域优先使用尚未使用的颜色。画笔与橡皮使用不同光标,并显示作用范围。
毫米:滑块 1–50 mm,精确输入 0.1–100 mm,默认 5 mm。相对视图:直径为视口较短边的 1%–25%,默认 3%;缩放时屏幕大小不变,实际毫米大小随之变化。
选择 当前切面 / 3D 球形 后拖动,松开提交,Esc 取消;一笔对应一次撤销,其他分割不受影响。分割管理旁提供撤销、重做图标,悬停显示本机快捷键。教程入口位于顶部切面选择旁。CT、MR、PET 的 MPR 均可使用;阈值结果首次精修后转为固定体素掩膜。

连通区域
选择 仅保留选中块 / 删除选中块,点击所选分割内部。按三维六邻域(共享面)识别连通区域,不按二维轮廓操作。结果支持撤销;橡皮清空分割后可以继续绘制,导出 DICOM SEG 前须补绘或删除空项。
轮廓与填充显示
展开分割面板的 显示,选择 填充 / 轮廓 / 填充+轮廓。默认填充+轮廓、填充不透明度 30%;滑块 0–100%,数值越高遮挡越强。仅轮廓模式下滑块禁用,原值保留。轮廓显示当前切面实际掩膜的内侧像素边界,包括孔洞和独立区域;不做平滑。设置作用于当前页签所有分割(4D 各时相共用),不影响其他页签或 VOI。显示设置随工作区保存,不改变掩膜、统计和 SEG / NRRD 导出;隐藏仍由各分割的显隐按钮控制。
NRRD / Slicer 交换
在原始 DICOM 的 MPR / 4D 中选择 导出 → 导出 NRRD / Slicer,输出当前时相体数据 source.nrrd 和分割 segmentation.seg.nrrd(含隐藏项和重叠区域)。在 Slicer 中分别加载,编辑并保存 .seg.nrrd;回到原 DICOM 的同一时相,通过右侧 导入分割 → 导入分割 · SEG / NRRD 导入。也支持三维整数标签 NRRD。文件须使用毫米单位及 LPS/RAS 坐标;不一致网格会拒绝导入,不自动重采样。NRRD 通常没有可靠的患者/序列身份信息,请确认参考影像和时相。
本地自动分割:环境
在 设置 → AI → 本地自动分割 点击 检测环境。软件查找专用 TotalSegmentator-Local、常见 Conda 环境及 PATH 中已安装 TotalSegmentator 的解释器;未找到时打开 高级配置,手动选择 Python 解释器和模型目录。Windows 选择环境中的 python.exe(venv 通常在 Scripts 中,Conda 通常在环境根目录);macOS 选择 bin/python。手动配置优先保留,恢复自动发现 可清除路径覆盖并重新检测。路径仅在悬停提示中显示。
模型目录应包含 Dataset297_TotalSegmentator_total_3mm_1559subj,也可选择该模型、训练器或 fold_0 目录,软件会识别其上级目录。检测检查依赖、调用接口、设备、模型文件及 JSON 配置;不会运行分割,不保证显存充足或权重文件无损,不安装依赖或下载模型。自动 依次选择 CUDA、Apple MPS、CPU。保存的设备若不可用会明确标注,需改选,不会静默替换。
已实测组合为 TotalSegmentator 2.18.0、macOS / MPS。其他版本或平台即使接口检查通过,也显示尚未实测;接口或 CT 快速模型变化时拒绝使用。升级环境后请重新检测,并用样例复核分割和空间位置。Windows 环境发现有自动化覆盖,尚未完成 Windows 实机验收。
本地自动分割:运行
在 CT 的 MPR / 4D → 分割 面板顶部点击 自动分割 图标。确认序列和当前时相,搜索并勾选器官,然后开始。默认肝脏、脾脏、双肾;保留上次选择。输入为当前时相完整原始 HU 体数据,不受窗值、显示裁剪和旋转影响。仅支持可靠标定的规则正交 CT 网格;不支持 MR、普通 2D、非 HU 派生图、剪切及不规则体数据。
部位列表在检测环境时从所选 TotalSegmentator 的 total 模型标签表读取,表示模型支持的结构,不表示本次影像已经检出这些器官。VoxPlane 提供中英文名称,未收录的名称显示英文。升级环境后重新检测可刷新列表;不能通过输入名称添加模型不支持的结构。
本地自动分割:结果与取消
运行时可继续浏览;切换时相或正在编辑时,结果暂存,返回目标时相并结束编辑后导入。关闭目标或替换数据会丢弃结果。可取消,失败和取消均不导入半成品;详细原因与日志位于 详情。不会因 GPU 失败自动改用 CPU。
全部校验通过后,结果一次性追加;重复运行不会覆盖原分割,整批支持撤销重做。未检出的器官跳过提示。可继续改名、换色、显隐、调整轮廓/透明度和画笔精修,保存工作区或导出 SEG / NRRD。工作区恢复无需 TotalSegmentator,也不会重新计算。自动结果需由使用者核查和精修。
成功导入后,部位选择和详情弹窗自动关闭,显示分割结果;面板保留完成数量及未检出部位提示。失败时,部位选择弹窗保持打开并显示具体原因,保留已选部位,可查看详细日志并重试。
